你好！具体情况不是很清楚，你还需要找单位的相关负责人询问。你所说的2008年3月－2009年9月的医保费，是不是指每月划入医保存折的那部分钱？如果是，这期间单位没有给你交保费，当然不会有这部分钱，现在补上了，只是今后的利益有了保障，前面中断的部分社保是不给补的。至于说保费少了，很可能是单位给你补办后是按较低的基数交的。以上仅仅是我个人根据你在这里提供的情况所做的推测，只能做个参考。具体的实际情况还是要找直接经办这个事儿的人，因为这里面有暗箱操作的因素，所以你了解起来可能不会太顺利，实在不行，就直接去社保问问。