医疗机构的保险承担主体通常是由医疗机构自身承担，这是为了保障医疗机构在运营过程中发生意外或责任事故时能够及时获得赔偿，以保持其正常运营和服务能力。

在医疗机构的运营中，医疗保险通常包括医疗责任险、医疗事故保险等，这些保险主要涵盖了医疗机构在提供医疗服务过程中可能面临的责任和风险。医疗责任险主要是为了保护医疗机构在医疗过程中可能产生的医疗事故或医疗纠纷，确保医疗机构能够承担赔偿责任；而医疗事故保险则是为了保障医疗机构在医疗事故发生时能够得到赔偿，以减轻其经济压力。

除了医疗机构自身承担的保险之外，有些医疗机构会购买额外的商业保险，如财产保险、雇主责任保险等，以进一步保障医疗机构的资产和员工。这些商业保险通常是根据医疗机构的实际情况和需求来选择购买的，以应对各种意外风险和损失。

医疗机构的保险由医疗机构自身承担是一种必要且常见的做法，通过购买适当的保险产品，可以有效保障医疗机构在运营过程中的各项风险，确保其正常运营和服务质量。