目前，我国医疗保险在很多地方仍然是城乡分设，新农合归卫生部门管理，城镇居民医疗保险由人社部门管理，在当前我国实行全民医保的情况下，医疗保险管理城乡分割带来的问题日益突出，影响了全民医保的公平性。建立统一的城乡医保管理制度，是当前社会公平的迫切需要，是落实党的十八做出的整合城乡居民基本医疗保险决策的要求。
一、当前，我国城镇居民医疗保险在筹资水平、报销范围、待遇支付水平都高于新农合，农村医疗服务提供水平也低于城镇地区。这些都严重影响了全民医保的公平性。
二、城乡居民管理体制分设、制度分割，造成部分居民重复参保，国家财政重复补助。
三、经办机构分设，造成经办资源重复建设，增加了管理成本，浪费国家财力、物力，也降低了管理效率。
四、基金抗风险能力减小。医疗保险属于现收现付制，参保人数多，抗风险能力就越强。体制分设、制度分割就会造成参保人员分割，基金分算，抗风险能力减小。
五、管办不分难履职。新农合归卫生部门管理是既当裁判员，又当运动员，难以正确的履行监管职能，无法真正约束和规范医疗机构的服务行为。
上述的五个问题是医疗保险管理城乡分割导致的很明显可以看到的，所以此问题对于和谐社会来说是急需解决的，党的十八大做的决策是为了建立统一的城乡医保管理制度，我们拭目以待。