随着我国社会基本保障制度的发展和完善，社会基本保障以覆盖面广，保障全面给人民群众带来了社会最基本的保障，对社保的不足，国家还以补充保险的形式进行了补充，以健全发展我国多层次社会保障体系。企业为员工所上的企业补充保险是要根据国家政策缴纳补充医疗保险个税的。

在国家的免税政策中，企业缴纳基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，是可以免征个人所得税的；个人按照国家或省、自治区、直辖市人民政府规定的缴费比例或办法实际缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，可以在个人应纳税所得额中扣除。超过规定的比例和标准缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，将超过部分并入个人当期的工资、薪金收入征纳个人所得税。从中我们可以看到，免税项目中并不包括补充医疗保险，因此，补充医疗保险个税也是要缴纳的。补充医疗保险是对社会基本保险的很好补充，都是为了给职工提供医疗保障的方式。

企业办理补充医疗保险时应缴纳的补充医疗保险个税由企业代交，补充医疗保险一般由商业保险公司代管，在保险公司落到被保险人的保险账户时，由企业代扣代缴个人所得税，即和工资收入一起，由公司代缴即可。

补充医疗保险个税也并不是全部都要缴纳，北京市基本医疗保险规定中就明确规定，企业补充医疗保险费在本企业职工工资总额的百分之四以内的部分，可以列入成本并准予税前扣除。以新一站保险网中的商业补充医疗保险为例，有不少企业为员工购买了小微企业团体意外险。平安小微团体意外险提供因意外事故造成的伤害、身故、残疾以及意外医疗保险金，并有意外住院误工和护理津贴，还提供电话医疗服务和医疗费用垫付服务，是社会基本医疗的极好补充，虽然属于商业补充保险，但是并不用缴税，是企业为员工提供的最好福利。

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